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M13單鏈絲狀噬菌體展示系統是目前應用廣泛的文庫展示系統，通過將蛋白、抗體或多肽與噬菌體pIII蛋白融合表達，使之參與噬菌體組裝，并展示在噬菌體表面，形成噬菌體展示文庫。

離子通道也是一類重要的膜蛋白，一些細胞正常的生理活動與一些疾病的病理進程，是通過修飾膜通道構象實現的，所以離子通道蛋白也是一些藥物的重要靶標。目前基于小分子穿梭膜通道的方法，人們已經開發了數種作用于特定細胞離子通道的藥物，例如我們常聽說的阿司匹林，就是一種非常常用的質子泵抑制劑。

G蛋白關聯受體（GPCR）家族是一類7次跨膜蛋白，也是許多疾病治療藥物的靶點，一些自身無法靶向GPCR的藥物，在一些靶向GPCR分子的帶領下，作用于GPCR同樣被證實具有藥理活性。

傳統抗體制備方法用于制備抗膜蛋白的抗體，面臨方方面面的問題，但是綜合時間與技術難度，單克隆抗體制備對于某些結構較為簡單，要求較為單一的膜蛋白抗體制備，仍不失為一種經濟有效的方法。

在哺乳動物的免疫起始步驟，抗原都不是直接由Th細胞處理的，而是由抗原呈遞細胞（APC）來完成抗原的加工與呈遞的。如果我們能制備表達目的抗原的細胞，那么這些抗原將在此細胞表面大量表達，類似于APC一樣使其表面帶有抗原決定簇，那么這個細胞就可以用來作為抗原免疫動物。

制備抗自體抗原抗體指的是用在正常免疫動物本體存在的正常蛋白、小分子，或者采用與天然免疫動物具有高度序列保守性或結構一致性的其他物種的蛋白、小分子作為抗原或半抗原免疫這些動物本身，來制備相應抗體的情況。